קדושת בית המדרש גדולה מקדושת בית הכנסת, ולכן עדיף להתפלל שם אפילו אם יש שם מנין מצומצם, מלהתפלל בבית הכנסת ברוב עם. (שו"ע סי' צ)
ב. ולא רק מי שלומד בעצמו בבית המדרש, אלא אף אחרים, מוטב שיתפללו בבית המדרש הקבוע ללימוד תורה של רבים, מאשר שיתפללו בבית הכנסת, שקדושתו פחותה. (שם ומשנ"ב שם)
