א. הטעם שתיקנו את ברכת 'אתה חונן' כברכה ראשונה מהברכות האמצעיות, כיון שיתרון האדם על הבהמה הוא בשכל, ואם אין בינה אין תפילה. (שו"ע ומשנ"ב סי' קטו)
ב. ועוד, כי החכמה והדעת הם הדבר החשוב ביותר, ולכן צריך לכוין בברכה זו כראוי, שזה עיקר השאלה שצריך האדם לשאול מאת הבורא יתברך, שיתן לו שכל ודעת ישר למאוס ברע ולבחור בטוב. (שם)